代扣代缴的企业不需要对个人所得税进行年度的汇算清缴。
根据《个人所得税自行申报办法》对于年收入超过12万元的高收入个人，需要在次年三个月内向当地地方税务机关进行自行申报，填写《个人所得税纳税申报表（适用于年所得12万元以上纳税人申报）》，相当于进行汇算清缴了。
根据《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函〔2009〕3号）第一条规定，《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第三十四条所称的“合理工资薪金”，
是指企业按照股东大会、董事会、薪酬委员会或相关管理机构制订的工资薪金制度规定实际发放给员工的工资薪金。
一般情况下都是企业进行代扣代缴，因为个人所得税工资薪金这块，税务貌似还没开发出单独申报的模块。只有在年收入超过12万元以上的，才会有个人补充申报模块。
扩展资料：
根据《企业所得税暂行条例》及其实施细则，《中华人民共和国税收征收管理法》及《国家税务总局关于企业所得税汇算清缴管理办法》（1998-10-20国税函[1998]182号）等法律的规定
一、汇算清缴期限
内资企业缴纳所得税，按年计算，分月或者分季预缴。
纳税人应当在月份或者季度终了后十五日内，向其所在地主管税务机关报送会计报表和预缴所得税申报表；
年度终了后四十五日内，向其所在地主管税务机关报送会计决算报表和所得税申报表，在年度终了后五个月内结清应补缴的税款。预缴税款超过应缴税款的，主管税务机关予以及时办理退税，或者抵缴下一年度应缴纳的税款。
二、应注意的是：
⑴实行按月或按季预缴所得税的纳税人，其纳税年度最后一个预缴期的税款应于年度终了后15日内申报和预缴，不得推延至汇算清缴时一并缴纳。
⑵若纳税人已按规定预缴税款，因特殊原因不能在规定期限办理年度企业所得税申报的，则应在申报期限内提出书面延期申请，经主管税务机关核准后，在核准的期限内办理。
⑶若纳税人因不可抗力而不能按期办理纳税申报的，可以延期办理；但是，应当在不可抗力情形消除后立即向主管税务机关报告。主管税务机关经查明事实后，予以核准。
⑷纳税人在纳税年度中间破产或终止生产经营活动的，应自停止生产经营活动之日起30日内向主管税务机关办理企业所得税申报，60日内办理企业所得税汇算清缴，并依法计算清算期间的企业所得税，结清应缴税款。
⑸纳税人在纳税年度中间发生合并、分立的，依据税收法规的规定合并、分立后其纳税人地位发生变化的，应在办理变更税务登记之前办理企业所得税申报，及时进行汇算清缴，并结清税款；其纳税人的地位不变的，纳税年度可以连续计算。
参考资料来源：百度百科-汇算清缴
