武汉大学的樱花已经有着很长的历史，更有着复杂的历史背景，关于武大樱花多数人并不很清楚，只是停留在日本军人栽种的那种认识状态上。1939年日军当年在武大种下的小日樱花不超过30株，主要分布在今天的樱花大道上。抗战胜利后，武大于1946年10月复归珞珈山；1947年3月，武大生物系师生观察发现，校园里共有28株樱花树开花，它们均匀地分布在老斋舍三个拱门之间及其两侧的四个门栋前（每个门栋前各有7株）。（至今那些日军栽种的樱花树都早已老死。）
武大樱花最初由周恩来总理1972年转赠。1982年，为纪念中日友好10周年，日本友协和日本西阵织株式会社又赠送武大100株垂枝樱苗。1992年，在纪念中日友好20周年之际，日本广岛中国株式会社内中国湖北朋友会砂田寿夫先生赠送樱花树苗200株。现今武大校园各处的樱花树苗，除园林工人自行培育的之外，大多都来自于此。 2011年，武大校园内已有樱树1000多株，内含日本樱花（即江户樱花）、山樱花、垂枝大叶早樱和红花高盆樱桃（经常被误称为云南樱花）共四个植物学种和十多个栽培品种或变种
