合伙企业的股权转让所得属于合伙企业的生产经营所得，依据合伙企业生产经营所得采取"先分后税"的原则，对于 个人投资人，比照个人所得税法的"个体工商户的生产经营所得"应税项目，适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收 个人所得税；对于 法人企业投资者，应当按适用 税率缴纳 企业所得税。
一些地方为了鼓励 股权投资类 合伙企业，关于" 合伙制股权基金中 个人合伙人取得的 收益"，对不 执行合伙事务的个人合伙人，按" 财产转让所得"征收20%的个人所得税，对执行合伙事务的个人合伙人，则比照"个体工商户的生产经营所得"，征收5%至35%的累计 所得税。例如：《上海市 金融办、上海工商局、 国税局、 地税局关于本市 股权投资企业工商登记等事项的 通知》（沪金融办通[2008]3号） 规定：执行 有限合伙企业合伙事务的 自然人普通合伙人，按照 《中华人民共和国个人所得税法》及其实施 条例的规定，按"个体工商户的 生产经营所得"应税项目，适用5%-35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。不执行有限合伙企业合伙事务的自然人 有限合伙人，其从有限合伙企业取得的股权投资收益，按照《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，按" 利息、 股息、 红利所得"应税 项目，依20%税率计算缴纳个人所得税。也有部分地方对股权投资类合伙企业自然人合伙人统一按20%的税率征收个人所得税。例如：北京市《关于促进 股权投资基金业发展的 意见》（京金融办〔2009〕5号）规定：合伙制 股权基金中个人合伙人取得的收益，按照"利息、股息、红利所得"或者"财产转让所得"项目征收 个人所得税， 税率为20％。
