一、两者的文凭学历不同：
1、注册入学的文凭学历：注册入学的文凭学历一般高于对口单招的文凭学历。
2、对口单招的文凭学历：属于高等职业教育和中职教育的招生方式，因此，其文凭学历低于注册入学的文凭学历。
二、两者的条件不同：
1、注册入学的条件：凡参加普通高校招生全国统一考试未被统一录取，且取得全部七门科目学业水平测试成绩的考生，均可申请注册入学。院校可在此基础上，对申请注册该校的考生提出高考成绩和学业水平测试等级的要求。
2、对口单招的条件：具有正式学籍的中等职业学校毕业生，坚持四项基本原则，具有坚定正确的政治方向，遵纪守法，道德品质良好，学习成绩优秀，身体健康，在校期间未受过纪律处分，经本人自愿申请并由所在学校审查推荐，均可报名。
三、两者的概述不同：
1、注册入学的概述：注册入学是指考生根据院校提出的报考条件和录取要求，结合自身条件，向1-2所试点院校提交注册申请。
2、对口单招的概述：对口单招，又称对口高考，对口升学，是从中等职业学校毕业生招生，强调中等职业学校毕业生对口升高职的专业技能考试，以专业技能成绩为主要录取依据的招生办法。是相对于普通高中生参加的普通高考的另一概念。对口单招是为了培养应用型高技能人才而推出的一种招生形式。
注册入学和对口单招的教育水平需要根据不同地区的教育发展程度具体判断。
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