首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请，申请材料有：居民身份证及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）以及填写《中国公民出入境证件申请表》，2寸淡底色彩照2张（也可现场拍照，费用自付），同时分别申请赴香港、澳门的签注。
只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。
办理时限：自受理之日起10个工作日（首次或非首次申请）。但均不含邮递日（一般在五天左右）以及节假日。
费用：《往来港澳通行证》每本80元；一次往来签注，每个15元，二次往来签注，每个30元。
代办：若是首次申请办理港澳通行证需要携带本人身份证以及照片；若非首次申请，则需带好本人身份证及前一次办理的通行证，如请人代办还需携带代办人身份证。
扩展资料：
一、办理费用
1、证件及签注
2017年7月起，港澳通行证收费标准将由每证100元降为每证80元。一次有效签注由20元降为每件15元，短期（不超过一年）多次有效签注由100元降为80元，长期（三年以上，含三年）多次有效签注由300元降为240元。
2、EMS寄送服务
新办/补办港澳通行证EMS单向寄送服务：18元
港澳通行证续签EMS同城双向（收证+递交+取证+寄递）四程办理服务：25元
港澳通行证续签EMS异地双向（收证+递交+取证+寄递）四程办理服务：45元
二、办理时间
申请《往来港澳通行证》及签注：15个工作日。
网上申请、电话申请签注8个工作日；窗口申请、EMS代办点申请签注10个工作日。
三、领取方式
本人领取：凭本人申请回执单及缴费收费，并携带身份证或户口薄，到受理申请的出入境管理处领取。
他人代理：代理人携带申请回执单，本人身份证、通行证申请人身份复印件到出入境管理处领取。
EMS上门：在办理港澳通行证当天凭申请回执单到出入境管理处邮政速递柜台办理手续并缴费。
四、电子证件
2014年5月，公安部在广东试点启用电子往来港澳通行证，5月20日起受理申请。即将启用的电子通行证存有数字化的个人资料和指纹信息，可以使用口岸自助查验通道实现自助通关。
电子往来港澳通行证启用后，内地居民往来港澳地区的管理政策不变，证件申请受理渠道和审批条件不变，收费标准不变。现行本式往来港澳通行证和签注在有效期内可以继续使用，持本式通行证可以继续申办贴纸式签注。
1、全面启用
据网易等媒体报道，2014年9月15日起，全国正式启用电子往来港澳通行证，据了解，电子版港澳通行证正面打印有持证人照片及姓名、出生日期、签发机关、签发地等签发管理信息，背面则打印往来港澳签注信息。
签注信息可由出入境管理部门重复擦写，不再附发贴纸式签注，减少了因签注页满换证的情况，降低了使用成本。
2、无需贴纸
电子往来港澳通行证为参照有关国际标准设计制作的卡式证件，内部嵌有非接触式集成电路芯片，存储持证人个人资料及证件、签注签发管理信息，采用成熟的数字安全防伪机制进行保护，印制过程中还使用了多项物理防伪技术，防伪能力明显增强。
新版通行证正面打印持证人个人资料以及证件签发管理信息，背面打印往来港澳签注等信息。签注信息可由证件签发机关重复擦写。新版通行证不再附发贴纸式签注。
内地和港澳地区口岸查验部门查验时也不再加盖验讫章，签注使用情况由计算机信息系统记录管理，有需要的持证人可向内地及港澳地区主管部门查询签注剩余次数等信息。
3、需采集指纹
根据《中华人民共和国出境入境管理法》的规定，经国务院批准，公安机关出入境管理部门对首次申请电子往来港澳通行证的申请人将采集或核验指纹。留存指纹后，符合条件的持证人在通关时可以使用内地和港澳地区口岸的自助查验通道。
为确保持证人指纹信息安全，内地和港澳地区主管部门均建立了严密的管理制度，并采用多种技术保护措施，芯片中存储的持证人指纹模板信息无法被还原为原始指纹图像。 [8]
4、收费标准不变
电子往来港澳通行证及签注的收费标准不变。电子往来港澳通行证启用后，仍在有效期内的现行往来港澳通行证（本式）及往来港澳签注（贴纸式）可以继续使用。持用本式往来港澳通行证的，可以继续申请贴纸式往来港澳签注。
参考资料：百度百科--中华人民共和国往来港澳通行证
