距离旧金山最近的话，当然是加州大学旧金山分校了，简称为UCSF，华人经常称之为旧金山加大，是一所位于旧金山的公立大学，是加利福尼亚大学十个分校之一，也是加州大学系统中唯一的只专注于健康和生命科学的分校，以医学和生命科学而闻名。加州大学旧金山分校的医学院在全美国排名五名以内，在《美国新闻与世界报道》的美国医院排名中，加州大学旧金山分医学中心排在前10名之内。但是，这所学校不招收本科生，只开设硕士和博士专业，因此大学排名上经常找不到。但是旧金山加大在医学界声名显赫，是全世界生命科学和医学类学生的梦想之地。
如果找本科院校，距离旧金山最近的话，无疑是加利福尼亚大学伯克利分校，那是美国最负盛名且是最顶尖的一所公立研究型大学，位于旧金山东湾伯克利市，是加利福尼亚大学10所校区中最老的校区，于1868年建立，是美国最自由、激进的大学之一，其经济学、社会学等人文社科长期处于世界顶尖水平。
