可可西里无人区危险之一，便是它恶劣的天气和自然条件。平均海拔达到5000米，短时间内可以快速引发肺部疾病。一旦发生肺水肿、脑水肿就非常危险。而且这里广泛分布的是咸水湖，找到淡水非常困难，生存机会渺茫。
其次，复杂的地貌，如泥潭、沼泽、沙漠、湿地在无人区里更是遍布，无论是人或是车子不小心陷入泥潭，都是无能为力之事。如果原地等待，由于通讯设备无法使用，不能及时通知救援，其危险可想而知。
如果不幸被动物袭击，生还也是几无可能。可可西里人迹罕至，自然环境险恶，却是“野生动物的乐园”。可可西里栖息着藏羚羊，野牦牛，棕熊、野狼、和饥饿的胡兀鹫等动物，它们充满野性，有可能袭击人类。
总之，无论是自己徒步或是驾车穿越可可西里无人区，瞬息万变的天气、强劲的风力、高寒缺氧、对路况的误判、可能遭遇的野生动物以及各种天然陷阱，沼泽，冰层，河道等等都是危险所在，人是很脆弱的。
