国家财政部和国税局既不是隶属关系，也不是上下级关系，是两个完全独立的部门。不过，两者都归属于国务院管辖。
扩展资料：
中华人民共和国财政部是中华人民共和国负责财务的国务院组成部门。其前身为1949年10月1日成立的中央人民政府财政部。 2018年3月，根据第十三届全国人民代表大会第一次会议批准的国务院机构改革方案，将财政部有关农业投资项目管理职责整合，组建中华人民共和国农业农村部；将财政部的中央预算执行情况和其他财政收支情况的监督检查的职责划入中华人民共和国审计署。
国家税务总局，为中华人民共和国国务院主管税收工作的直属机构。1998年3月29日，国务院发布《国务院关于机构设置的通知》（国发〔1998〕5号）；同年6月22日，国务院办公厅关于印发《国家税务总局职能配置内设机构和人员编制规定的通知》，正式设置国家税务总局（正部级）。
2018年3月，根据中共中央印发的《深化党和国家机构改革方案》，将省级和省级以下国税地税机构合并，具体承担所辖区域内各项税收、非税收入征管等职责。
参考资料：国家财政部 百度百科
参考资料：国家税务总局 百度百科
