VCF格式的文件用什么软件打开?

2022-07-31 科技 246阅读

可以下载一个TextForever软件,进行转码。

需要转换编码,下载一个TextForever的转化软件,大小只有550k,在PC上直接运行编码转换,将原VCF文件的Unicode转换为GB即可在电脑上查看了。如果需要PC和手机同步,用系统自带的开始——附件——通讯簿打开。

扩展资料:

VCF是Variant Call Format的简称,是一种定义的专门用于存储基因序列突变信息的文本格式。在生物信息分析中会大量用到VCF格式。例如基因组中的单碱基突变,SNP, 插入/缺失INDEL, 拷贝数变异CNV,和结构变异SV等,都是利用VCF格式来存储的。将其存储为二进制格式就是BCF。

vcf基本上都是直接从bam格式文件中生成的,也就是将bam文件中与参考序列比对异常的位点输出出来,当得到排序后并建立索引的bam之后,可以使用很多工具,例如bcftools,gatk,freebayes,lumpy,delly,varscan2等等工具。

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