一、明确几点基础
1、提问里的3%和17%，就增值税发票而言指的是增值税的税率。增值税的税率根据一般纳税人和小规模纳税人的不同，设置了不同的税率。
2、区分一般纳税人和小规模纳税人
一般纳税人的界定：增值税纳税人（以下简称纳税人），年应税销售额超过财政部、国家税务总局规定的小规模纳税人标准的，除《增值税一般纳税人资格认定管理办法》第五条规定外，应当向主管税务机关申请一般纳税人资格认定。(1)
小规模纳税人的认定标准(2)：
(1)从事货物生产或者提供应税劳务的纳税人，以及以从事货物生产或者提供应税劳务为主，并兼营货物批发或者零售的纳税人，年应征增值税销售额在50万元以下(含本数，下同)的;
(2)除上述规定以外的纳税人，年应税销售额在80万元以下的。
二、一般纳税人和小规模纳税人的具体税率
（一）一般纳税人增值税税率：
1、纳税人销售或者进口货物，除下述第2项、第3项规定外，税率为17%。
2、纳税人销售或者进口下列货物，税率为13%：
（1）粮食、食用植物油；
（2）自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品；
（3）图书、报纸、杂志；
（4）饲料、化肥、农药、农机、农膜；
（5）国务院规定的其他货物。
3、纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。
4、纳税人提供加工、修理修配劳务（以下称应税劳务），税率为17%。
（一）小规模纳税人增值税税率
小规模纳税人增值税征收率为3%。(3)
三、二者区别
（一）开具主体不同，就增值税开具主体来说，3%税率一般是小规模纳税人使用较多的；17%是一般纳税人使用较多；
（二）发票性质不同；3%的税率在增值税普通发票使用较多的；17%税率常见于增值税专用发票；
抵扣作用不同：针对小规模纳税人的3%税率所开票是不能抵扣进项税的；而针对一般纳税人的17%税率所开票是可以抵扣进项税。（也就是前者所得发票要进入成本；后者可以拿来抵扣，减少成本）
引用资料
《增值税一般纳税人资格认定管理办法》第三条.
《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》《中华人民共和国增值税暂行条例》.
《中华人民共和国增值税暂行条例》第十二条.
