加强高速公路运营企业成本控制的科学性的方法：
一、合理设置成本管理组织结构。合理的组织架构对控制成本有着显著的作用，以目标成本法为例，高速企业在分解目标成本的时候，要根据各个职能部门来划分。因此，合理的组织架构能够直接影响目标成本分解的方式。同时，因为各个职能部门的工作内容各不相同，各部门所获得企业的资源是不一样的，部门能够得到多少资源配置，将决定了它日后工作的成本支出。作为高速公路运营企业，要根据自身行业的特性，尽量把成本控制与部门职能结合起来考虑，为进行有效的成本控制提供组织保障。
二、主要职能部门要加强成本控制。高速公路运营企业要成立自己的成本管理部门，它负责目标成本的制定、制作成本计划、控制成本、考核与分析等工作，对企业的成本管理负有主要责任，各部门要积极配合成本管理部门的计划，节约本部门的成本。在实际操作中，高速公路运营企业的财务部门应该承担这项职责，因为财务部门在管理成本上更具优势，它要承担成本控制方案的制定、可行性分析以及评估反馈等工作。
三、精心组织，科学养路。高速公路运营企业对公路养护费用要有效控制，必须在管理过程中做到精心组织，科学养路。（1）做好养护规划。高速公路建设完成后投入使用，在1至5年内，公路在哪些结构部位容易损坏是可以预见的，有的结构部位使用周期的长短也是能够预期的，要做到有目的性、有针对性的养护，必须做好1至5年的养护规划，测算出这期间每年的养护费用目标成本，并将该目标成本测算分解到公路结构的每一明细章节目录，保证不漏项。（2）养护招标。养护目标成本测算出来后，为了能够把实际发生的养护成本控制在目标成本之内，在每年初，必须确定好养护施工队伍。如何确定选择专业养护队伍呢？这就必须招标，由3家以上（含3家）的专业施工队伍进行报名投标，高速公路企业从中选择报价低、信誉好、施工管理能力强、经验丰富的施工队伍，从而，养护能力水平有了保障，养护成本大大降低。（3）养护监理。在养护施工过程中，为了使养护质量有保障，必须聘请有经验的监理单位进行监理，从而做到养护的每一个环节都有监督，提高养护质量，预防“豆腐渣”工程，减少返工风险，降低损失。
四、正确划分资本性支出与非资本性支出的界限。高速公路运营企业在运营管理中，发生的大中修费用，应根据该费用的受益对象和受益期限进行费用资本化或进行费用摊销，计入“在建工程”或“长期待摊费用”科目核算，不能直接计入“主营业务成本”科目核算，否则，就会虚增企业成本，虚减企业利润。
