购入甲材料先预付供应商5000元定金，收到材料，价款合计共5500元，用银行存款补交500元。
会计分录：1、支付预付款时：借：应付账款 5000
贷：银行存款 5000
2、收到材料并补交货款时：
借：原材料 5500
贷：应付账款 5000
银行存款 500
这样的分录是对的。因为，预付账款科目是核算企业按照合同规定预付的款项。而预付款项情况不多的企业，可以不设置预付账款科目，可将预付的款项直接记入“应付账款”科目。
拓展资料
预付款是买方在交易合同签订后即向卖方支付一定金额的预付款。此方式不利于买方，一般在交易货物供不应求时采用。买方要负担商业风险、积压资金，实际上是向卖方提供信贷; 而卖方在发货前就收到货款，有利于资金周转，也无商业风险。
预付款有两种情况： 一种是作为进口商执行合同的保证，通常称为定金，预付的期限短，占交易金额的比重不大; 另一种是进口商对出口商提供信贷，预付期限较长，金额较大。
参考资料：百度百科-预付款
