不是同一个车站，二者的主要区别是，车站地址不同、主要线路不同、车站规模不同，具体如下：
一、车站地址不同
1、南京站
车站地址：南京市玄武区龙蟠路111号。
2、南京南站
车站地址：南京市雨花台区玉兰路98号。
二、主要线路不同
1、南京站
主要线路：京沪铁路、宁芜铁路、宁西铁路、宁启铁路、沪宁城际铁路。
2、南京南站
主要线路：京沪高速铁路、沪汉蓉高速铁路、宁杭高速铁路、宁安高速铁路、宁合高速铁路。
三、车站规模不同
1、南京站
建筑面积：42万平方米（截至2019年12月）。站台规模：8台16线（截至2019年12月）。
2、南京南站
建筑面积：73万平方米（截至2019年12月）。站台规模：15台28线（截至2019年12月）。
参考资料来源：
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