通知发票已作废的单位，向对方说明情况，对方还未认证的情况下，让其退回发票联和抵扣联，重新开具正确的发票。如果对方已经认证了，那就需要做进项税额转出，你需要重新开具正确的发票，让对方重新认证抵扣。
另外把该作废的那张作废就行了。
扩展资料
《增值税专用发票使用规定》第十三条 一般纳税人在开具专用发票当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的发票联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理；开具时发现有误的，可即时作废。
作废专用发票须在防伪税控系统中将相应的数据电文按“作废”处理，在纸质专用发票各联次上注明“作废”字样，全联次留存。
第十四条 一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》。
《申请单》所对应的蓝字专用发票应经税务机关认证。经认证结果为“认证相符”并且已经抵扣增值税进项税额的，一般纳税人在填报《申请单》时不填写相对应的蓝字专用发票信息。
参考资料：百度百科——增值税专用发票使用规定
