往来港澳通行证在网上再次申请签注流程如下：
首先，户籍所在地的城市支付网上签注；
再者，第一次签注要在出入境部门办理。再次签注才能在网上申请。
办【港澳通行证续签】，需要填表政审（按需申请申领地区无需政审），随带户口本、身份证原件及复印件，符合标准相片一张，到户口所在地出入境管理部门申请，如果是要办理商务签注的，所在公司要到出入境管理部门先报备。
以广东省港澳通行证续签网上申请方式为例：
广东省户口的居民可以通过网上办理《港澳通行证》的续签，具体操作步骤如下：
1、登录“广东省出入境政务服务网”
2、按“网上申请”
3、填写相关资料，资料必须要准确无误
4、如果你的《港澳通行证》在广州，一定要选择邮递服务，地址填写你现在的地址，这样，在你的申请受理后，EMS快递公司的工作人员就会到你填写的地址收取《港澳通行证》，办理完成后，工作人员会将《港澳通行证》送到你填写的地址，很方便的，免去你回来奔走的麻烦。（快递仅限广东省内）
5、提交
6、打印或记下办理回执号，以方便日后查询办理进度。
办理费用：
签注1次有效20元（选择2次，则40元）
快递费用45元（因为不在东莞是跨地级市，要45元；如果同一地级市，则20元）
办理时限：
10个工作日左右。
