汽车合格证肯定是要交给车管所的。
汽车合格证原件在车辆上牌照时，由车管所做为车辆的原始凭证保存在车管所。只有车辆转籍到其他城市时提档转移。
扩展资料：
新车上牌的流程：
(一)验车须持资料
1、身份证原件和复印件，如果是代别人办的，自己的和车主的都要带。
2、发票原件和复印件。
3、合格证原件和复印件。
5、强险副本原件和复印件，强险副本会收去。
6、完税证明，副本会收上去。开车到车管所，如果是代办的，先到窗口找临时工复印空白委托书，自己办的直接开车到查验区。
(二)验车上牌手续
1、首先进行发票的工商验证。
2、对车辆进行外观、车辆尾气等检验，合格后由检测厂总检交警签字。
3、对车辆进行保险(保险单)。
4、去购置费征稽处购买车辆购置附加费。
以上手续办好后，须在占地证手续办理七天后方能拿车辆牌照(须用户本人同去)。
参考资料来源：百度百科—汽车牌照
