去银行办理扣税协议，国税和地税是需要分别签的。
银行办理扣税协议步骤：
带齐营业执照、税证、银行开户许可证、法定代表人身份证明复印件盖公章、公章。到了银行，银行会让你签托收协议，你就在上面盖公章。有部分银行是需要盖财务章和总经理章。
企业从银行帐户支付款项，需要企业开具支票或者其他支付凭证，盖章后银行才能支付，如果有了扣税协议，企业缴纳给税务局的税款，税务局就可以直接通知银行扣划税款，使企业应缴纳的税款能及时入库。
需要分别签订三方协议，可以是同一银行也可以是不同银行，建议开通电话通知，这样每一笔扣款都是实时掌握。
扩展资料
业务概述:税务机关根据有利于税收控管和方便纳税的原则，可以按照国家有关规定委托有关单位和人员代征零星分散和异地缴纳的税收，并发给委托代征证书。受托单位和人员按照代征证书的要求，以税务机关的名义依法征收税款，按时申报入库。
政策依据:《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》（国务院令【2002】第362号） 《国家税务总局关于清理简并纳税人报送涉税资料有关问题的通知》（国税函〔2007〕1077号 ）
办理部门:有国税的企业需要在国税局领取国寿扣款协议，地税扣款协议可以到地税大厅或者地税管理员那里领取!
纳税人办理时限:一般办理时间当天就好了，主要是需要把扣款协议填写好给到银行，银行办理授权扣款然后部分地区需要将银行盖章的扣款协议一份交由税务局保管，所以扣款协议又称为三方协议!
参考资料来源：瑞安市人民政府-国地税推出网上委托扣款协议
