计算个人所得税是依据应发工资进行核算的，在应发工资中已经扣除了公司的罚款，因此，个人被公司罚款是个人所得税税前扣除的。
税前扣除项目主要包括：
与取得收入有关的、合理的、实际发生的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。
一、税金:指销售税金及附加
1、六税一费：已缴纳的消费税、营业税、城建税、资源税、土地增值税、出口关税及教育费附加；
2、增值税为价外税，不包含在计税中，应纳税所得额计算时不得扣除。
3、企业缴纳的房产税、车船税、土地使用税、印花税等，已经计入管理费中扣除的，不再作为销售税金单独扣除。
二、其他支出，是指除成本、费用、税金、损失外，企业在生产经营活动中发生的与生产经营活动有关的、合理的支出。
扩展资料：
个人所得税免征额
所谓起征点，是征税对象达到征税数额开始征税的界限。征税对象的数额未达到起征点时不征税。一旦征税对象的数额达到或超过起征点时，则要就其全部的数额征税，而不是仅对其超过起征点的部分征税。
所谓免征额是在征税对象总额中免予征税的数额。它是按照一定标准从征税对象总额中预先减除的数额。免征额部分不征税，只对超过免征额部分征税。
二者的区别是：假设数字为2000元，你当月工资是2001元，如果是免征额，2000元就免了，只就超出的1元钱缴税，如果是起征点，则是不够2000元的不用交税，超出2000元的全额缴税，即以2001元为基数缴税。
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