新农合患者在镇级医院住院治疗起付线为100元/人次，报销比例是合规费用的100%; 市内县级定点二级医院住院治疗起付线600元/人次，报销比例为80%; 市内市级定点二级医院住院治疗起付线1000元/人次，报销比例为70%; 市内市级三级定点医院住院治疗起付线1800元/人次，报销比例为60%; 省级三级定点医院住院治疗起付线3000元/人次，报销比例为55%; 省级二级定点医院住院治疗起付线2000元/人次，报销比例为65%; 市内定点民营医院报销比例比照市级二级定点医院报销比例下降5个百分点，在市内未定点医院报销比例比照市级定点医院报销比例下降10个百分点，起付线不变。
新农合住院报销流程： 1、由门诊医生或住院部医生诊断，开具住院证； 2、持农合证到住院收费窗口缴费并做网络登记； 3、持住院证，缴款单到住院登记窗口登记，领取病历表及用品； 4、到对口专科进行住院检查、治疗； 5、出院时找自己的主管医师开具出院证、诊断证、住院者身份核对单； 6、持个人缴款单到出院结算窗口办出院手续； 7、持出院结算票据到所住科室护士站交出结算联，取回床位押金条，清点好床单元等物品，再到出院结算处取出结算发票，领回床位押金，到打印处打出清单汇总表； 8、凭结算发票单，农合证、身份证和户口簿原件及复印件，诊断证、住院者身份核对单、住院费用汇总清单到农合直补窗口报销，领取补助款。
