叛变的现代剧情就是讲圣殿认为一个阿布斯泰戈员工基因里的记忆可以对刺客组织造成沉重打击，最后强迫他加入圣殿。
大革命就是说刺客和圣殿想找一个圣者但是那个圣者的尸体和其余的几万具尸体一起被埋在公墓里了所以后没找到。
枭雄就是说刺客组织和圣殿同时争一个叫“圣骸布”的伊甸圣器结果最后没抢过圣殿，圣骸布被他们拿回去重构朱诺的肉体了。
起源引入了一个新的现代主角叫蕾拉，她是个阿布斯泰戈员工，改进了Animus并瞒着公司自己进行实验，结果被发现了被圣殿追杀，最后她朋友被杀，她自己被刺客组织找到了并接受了邀请与其合作。
奥德赛里与刺客组织合作了的蕾拉通过追溯这部古代主角的记忆（根据玩家的选择会是阿历克西欧斯或者卡珊德拉）找到了被封印了的先行者文明城市——亚特兰蒂斯，但是蕾拉找不到进入方法，这时候古代主角突然出现在蕾拉面前，并不是幻觉，就是活到了现代的本人。
古代主角告诉蕾拉，世界上缺少了秩序与混沌哪一边都不行，而他们的使命就是维持二者的平衡。
接着，古代主角将维持自己寿命的先行者遗物——“赫尔墨斯之杖”交给了蕾拉并且要求她保证在一切结束之后毁掉遗物，随后欣然接受了死亡。
最后蕾拉通过一个我忘了叫什么的依述人的引导下体验到了古代主角在亚特兰蒂斯经历的试炼以进一步了解自己的使命。
但蕾拉因为出血效应的影响失控杀死了一直关注自己健康的刺客组织成员——维多利亚-毕博。
最后的最后，蕾拉靠着赫尔墨斯之杖给予的不死能力击溃了追过来的阿布斯泰戈成员，奥德赛的剧情正式结束。
简短一点的话这差不多就是至今为止的现代剧情了。
