（一）科教与国际合作处
负责组织和协调中心的科研活动及国际合作与交流活动；
中心科研项目和国际合作项目的管理和督导；
拟定中心的科技教育发展规划和计划；
组织中心重点课题的申报和结题管理；
国家级继续医学教育项目的组织和管理以及中心所有项目的申报和立项；
外事接待、办理出国相关手续；
研究生及外来进修人员的组织和管理。
（二）项目管理办公室
承担卫生部交办的全国亿万农民健康促进行动、中国公民健康素养促进行动、疾病预防控制、妇幼卫生、农村卫生、食品安全、用药安全、职业卫生等重大健康教育和健康促进项目的策划、组织实施和检查督导，并总结推广适宜技术和方法。
（三）理论与政策研究室
开展健康教育与卫生新闻宣传领域的理论、方法与策略的研究，为卫生部制定相关的法律、法规、部门规章和技术规范等提供技术咨询及政策建议；
拟定健康教育工作规划，组织开展相关课题研究；
业务指导和联系《中国健康教育》编辑部。
（四）指导与评价部
组织开展医疗卫生机构、机关、学校、社区、公共场所、工矿企业等场所的健康教育与健康促进工作并进行业务指导及评价；
负责突发公共卫生事件中健康教育工作的业务指导；
全国健康教育、卫生新闻宣传活动效果的监测与评价；
总结推广健康教育与健康促进的典型经验和适宜技术。
（五）信息管理部
负责中心信息化建设工作；
组织收集、整理和发布与健康教育有关的核心信息；
中国健康教育网站的建设与维护；
建立、维护、管理健康教育传播材料资源库和图片音像资料库；
业务指导和联系《健康教育与卫生新闻宣传通讯》和《中国卫生年鉴》编辑部。
（六）健康传播部
负责各类健康传播活动的策划、组织和实施；
承担健康传播的信息开发和材料研制、整理和交流；
组织协调大众媒体与有关部门合作开展健康传播活动；
承担百姓健康频道编委会办公室工作；
业务指导和联系百姓健康电视频道和中国卫生科教音像出版社。
（七）培训部
负责了解全国健康教育、卫生新闻宣传人员队伍的状况；
承担健康教育与健康促进专业人员、卫生新闻宣传有关人员的业务培训及中心职工的学习培训，组织编写培训教材，组织师资力量和培训基地，开展相关专业人员的继续教育工作，建立全国健康教育、卫生新闻宣传工作网络。
（八）宣传服务部
负责卫生舆情收集、加工、整理和报告，协助卫生部组织新闻发布、媒体记者采访活动和重大新闻宣传活动的组织协调工作；
协助开展网上评论引导的组织工作和对网络健康知识传播的审核把关及监管工作，并协助负责卫生部网站建设和政务信息公开工作；
挖掘卫生系统先进典型，组织媒体并策划运用多种艺术形式加强正面宣传；
业务指导和联系《卫生部公报》和《中国卫生画报》社。
（九）报刊管理部
协助负责对卫生部主管媒体的日常监督管理，组织对重点报刊的审读工作以及视频节目审看、报刊年审和有关部门组织的评审工作；
协助组织对报刊管理人员、采编人员的培训工作；
协助组织对发布处方药广告专业刊物的认定及监督管理工作；
协助做好新办报刊的初审和上报工作；
负责《卫生部公报》、《百姓健康频道》、《健康教育与卫生新闻宣传通讯》和《中国卫生年鉴》编辑部、《中国卫生画报》和《中国健康教育》编辑部等机构的行政管理及发展计划、规划拟定和组织实施。
