九龙湖校区建设最早可以追溯到民国时期 ，经民国政府批准，国立中央大学1934年在南京中华门外征地2700亩建设新校区。此项学校建设史上的宏伟愿景，是罗家伦校长和一代知识分子教育救国的具体表现，因日寇野蛮侵略而夭折，费筹建经也被迫用到西迁路上和后方临时校舍的建设中。
东南大学在被誉为学府圣地的四牌楼校区走过了100余年的历程。随着高教大众化时代的来临，东大原有的办学用地和校舍设施严重不足，成为新百年、新发展难以逾越的障碍。
2002年，在江苏省、南京市和江宁区的大力支持下，东南大学决定在江宁经济开发区南部的九龙湖畔建设新校区，作为未来建设发展的主要区域。经历详细的设计和紧张的施工，最终于东南大学建校105周年之际，新校区落成庆典终于在风景优美的九龙湖畔举行，为东南大学105岁生日献上一份厚礼。2006年夏季起，东南大学主教学区迁至九龙湖校区，由此掀开东南大学发展史上崭新的一页。
不知不觉，湖区已经十岁了。图书馆不再空荡，道旁的枝条早已粗壮，教学楼下的玉兰十载花开花落，课桌讲台早已磨出岁月的斑驳。基础设施日渐完善，体育馆拔地而起，地铁三号线开通，我们的生活越来越便利，湖区，我们更加爱你。
