从理论上讲，不论用户是否佩戴眼镜（镜框式或者隐形眼镜）、护目镜、太阳镜，都能进行虹膜识别。但用户佩戴眼镜后，环境光经过镜片反射、折射后，很可能会形成不同程度的光斑等光学性干扰，从而在一定程度上影响用户进行虹膜识别的良好体验。
因此，对于用户而言，在选择虹膜识别产品时，要特别注意询问（最好是实际试用）厂商，其产品对佩戴各类眼镜用户的友好度有多高，是否能够做到佩戴各类眼镜后的使用体验，和裸眼使用的体验几乎一致，以此作为选购虹膜识别产品的重要依据。
至于美瞳，用户需在进行虹膜识别前将其摘下。原因很简单，各类美瞳上自带的纹理图案等，会遮盖该用户自身虹膜固有的纹理特征，进而影响识别。
