按发票金额的7%计算可以抵扣的进项，然后按发票金额的93%来计入运费的成本。
现在约定的金额*（1+7%）就是开票金额。运费抵扣是按运费发票的金额*7%。
流公司如果在营改增之前，他缴纳的税和取得发票的一方抵扣的税额是不一致的。例如100元的运费，获得发票的一方可以抵扣7元的税，支付93元的成本。而对于物流公司来说。
他要交100*3.3%=3.3元的营业税。并不是按照93%去倒推，因为运费抵棚盯樱扣实际上是国家税务上的一个补贴，相当于出票方缴纳3%的税，而支付方获得7%的链丛抵扣。
但是在营改增之后，运输业的费率改为11%，那样的话就是属于双方的税率相同了，但是计算方法就不是倒推了。
拓展资料：
税率，是对则洞征税对象的征收比例或征收额度。税率是计算税额的尺度，也是衡量税负轻重与否的重要标志。中国现行的税率主要有比例税率、超额累进税率、超率累进税率、定额税率。
即对同一征税对象，不分数额大小，规定相同的征税比例。中国的增值税、营业税、城市维护建设税、企业所得税等采用的是比例税率。
参考资料:百度百科-税率
