大部分是但不全是，现在市场上常见的主要就是减毒苗和灭活苗。这是通过使病原微生物降低或是失去生物活性的方法来达到引起免疫反应的效果。
除此之外还有：
载体疫苗，即利用其他微生物表达病原微生物的抗原蛋白，再由微生物导入人体引起免疫反应。这种方式的优势是可以很好的诱导机体的细胞免疫。
DNA疫苗，即将病原微生物的抗原蛋白重组到真核表达质粒中，再导入体内使其在人体中表达达到引起免疫反应的效果。该疫苗具有稳定性好、易于制成多价苗的特点，但诱导免疫反应弱。
VLP疫苗，VLP（virus like particle）即病毒样颗粒，是指体外表达病毒的结构蛋白使其自组装成为病毒外壳用于免疫。这种疫苗免疫效果好，安全性强。但是产量低、成本高。现在市面上的二价、九价HPV苗就是VLP疫苗。
