台铁和台湾高铁是两个完全不同线路的列车，台铁是环绕整个台湾岛的铁路系统，而台湾高铁只有在台湾西部共有十二个车站。
台铁和台湾高铁在部分车站是共用车站大楼的，方便乘客转搭乘台铁或高铁。高铁比台铁快速许多，同样从台北(台湾北部)搭车到高雄(台湾南部)，台铁需要3.5~5小时不等，高铁只需要1.5小时左右，虽然高铁的车站比较少，但是可以搭乘到附近的车站再转乘台铁到达目的地。
票价，同样以台北到高雄为例，依车种不同会有所差别。台铁：新台币650~843，高铁：新台币1490，以节省的时间来看，长途旅程搭乘高铁是比较划算的。
