个人经验回答如下
第一，任何人签任何国家的任何签证都有拒签的可能性，拒签是很正常的一种结果。
第二，日本签证审核的主要要素通过申请表可以看出，一是财力，二是犯罪和其他不良记录，三是目的与行程安排，四是担保。
财力通过户籍（无奈的国家现状）、资产证明、纳税证明等进行证明，同时纳税证明也体现守法性。财力证明主要的目的是确保不会超期滞留，所以提供房产证等不会抛诸脑后的财力证明（说明你不会扔下不管留在日本）会更有帮助。
犯罪和不良记录包括在中国国内的治安、刑事犯罪记录和日本国内的治安、刑事犯罪记录和不良出入境记录（超期滞留，无证打工等），申请表会要求如实填写相关记录，不实肯定拒签，如实（即有过不良记录的）却未必拒签。诚实是原则。
目的与行程安排是关系到签证的种类，请提供和实际安排一致的信息和文件，例如行程日历，机票酒店安排预订单等。需要注意的是，日本对个人单独出游是比较关注的，有些旅行社为了出签方便把单独出游的客人放在其他团里一起申报是有问题的，最好确定你的材料是跟你实际出游的团友一并提交的（也不排除某些导游代办其他人签证把单独出行或其他行程的人报在你们团里，查出来也有问题），并选择值得信赖的大旅行社。
担保目前采取的都是旅行社对旅行社的方式，即你们报的旅行团必定有日本国内对应的地接社做担保，你参团的旅行社一般也会要求缴纳一定的担保费用和押金冻结，一般这样都是正常操作。不过值得一提的是押金冻结个人不建议直接交给导游或者旅行社，一部分大旅行社都有合作银行专门可以开立账户进行第三方旅游资金冻结（也就是存在银行里，银行进行冻结），这样比较保险而且存款也有孳息（一般冻结都一个月，甚至有些可以做短期理财）。另外一点日本旅游回来后都会有归国报告书，跟团一般都是导游直接处理了，个人游记得找航空公司盖章回国后寄回给旅行社，旅行社才能和银行解除冻结。
基本上注意上述几点重点，出签成功率还是很高的，毕竟现在日本逐步进一步放宽中国人旅游。
