县人民政府办公室主任和县委办公室主任级别大小是一样的，都是正式正科级。两者主要区别有5点：1、所属部门不同。2、职能不同。3、管理的机构不同。4、上升空间不同。5、党员关系不同。
区别如下：
1、所属单位不同。
县委办公室主任：所属单位是中国共产党某某县委员会。
县人民政府办公室主任：所属单位是某某县人民政府。
2、职能不同。
县委办公室主任：协助县委领导督促检查县委重大决策、重要工作部署的贯彻执行和落实情况，办理、检查县委领导和上级领导机关的批示件及交办事项的落实，及时了解和报告执行及办理中出现的新情况、新问题，负责县委全面日常工作。
县人民政府办公室主任：县政府办公室主任是协助县政府综合管理全县经济建设和社会发展事业，主管县政府日常政务工作，实施行政指挥和监督，参与对国民经济进行宏观调控的职能部门主管。
3、管理的下属机构不同。
县委办公室主任：管理的下属机构有文秘组、综合组、委督查室、县委保密委员会办公室、政研信息室、后勤组、县委机要室。
县人民政府办公室主任：管理的下属机构有行政科、秘书科、督办科、法制科、信息科、外事办。
4、上升空间不同。
县委办公室主任：县委办主任很容易升任县委常委成为副县级领导，并继续兼任县委办主任。
县人民政府办公室主任：政府办公室主任一般不是政府党组成员（有的地方可能特殊），但可列席县长办公会和县政府常务会议。
5、党员关系不同。
县委办公室主任：县委办公室主任是县委党组成员。
县人民政府办公室主任：政府办公室主任不是政府党组成员。
参考资料来源：百度百科-县委办公室
