都可以。
不论是3月底换还是6月底换，办手续前你都要去大学留学生课，告诉他们你要更新在留，他们会给你表格填，然后帮你准备材料帮你递交。等新的在留下来后会给你通知书和护照，让你自己去交钱更换在留贴纸。
没有什么亏不亏的，反正大学你是4月份毕业，7月份毕业对你在日本就职还是考学没有太大影响。因为新规定，留学生毕业后有1年的找工作签证。
建议马上更新。考上大学了就不是就学生，应该尽快更换身份。因为你要搬家到大学所在城市。外国人登录，开设新的银行账户，办理保险等等都需要外国人登录证。你不更新在留，外国人登录证的在留资格也无法更新（除非你喜欢当就学生）；再说万一被警察查到，你会说不清楚的。就学生为何会跑到这里，打黑工？
为了不必要的麻烦，还是尽快更新了的好。
