深圳社保停缴三个月就会重新计算参保年限。根据《深圳市社会医疗保险办法（修订稿）》第二十五条规定：在医疗保险年度内累计中断参保超过3个月的，重新计算参保年限。
针对“医疗保险中断后不能补缴”这一规定，深圳市社保局新闻发言人黄险峰解释，养老保险是“部分积累制”，即用现在的钱养将来的老，要求基金长期平衡，所以中断以后又恢复缴费的，其缴费年限可以累计计算。
而医疗保险是“现收现付”制，即用现在的钱看现在的病，要求基金当期平衡。“特别是统筹基金是用来互助共济的，当期参保的当然应该享受待遇，当期没有参保的就不能享受待遇了，否则就会损害全体参保人的利益。”
扩展资料：
深圳市社保局医保处处长沈华亮解释，深圳医保分为综合医保、住院医保、劳务工医保三种类型，其中住院医保、劳务工医保缴费较低，采取门诊统筹的方式看病，并未建立个人账户，也不存在清零。而缴费最高的综合医保设个人账户，但不会清零。
沈华亮说，参保人中断参保后，个人账户的钱不但一分也不会少，而且账户余额除可继续在门诊使用外，还可以转移和继承。
所谓“清零”，其实是指“连续缴费年限”的重新计算，一旦该年限被重新计算，将会影响下一年度的医保待遇。但参保人缴纳医保的“累积缴费年限”和个人账户余额并不受医保中断影响，更不会“清零”。
参考资料来源：人民网-深圳社保局回应“医保断缴3个月清零”系误读
