简单来说，这是不同的法旦慧律关系，你不可以去堵门阻止营业。逐一来说：
第一、药店老板借你钱，这时你们之间就成立了借贷合同关系，根据合同的相对性，约束的对象只是你和对方两人。现因为对方不还钱被诉至法院，那么进而形毁做成了诉讼法律关系。
第二、如果被堵门的药店所有权为该药店老板（以工商登记为准），你完全可以通过诉讼保全的方式争取你的利益。而且如果该药店老板有车辆、存模余答款、房产等财产的同样可以采取保全措施，以保障你将来胜诉后执行对方的相关财产。
第三、无论你是否对药店采取保全措施，在诉讼期间你如果堵门阻挠药店营业，对方完全可以制止你，强制你离开，甚至可以报警，让警察来处理，且如果情节严重的话你还有可能受到治安处罚，如警告、罚款、拘留等。因为堵门行为与借款以及诉讼行为不具有关联性。去堵门则形成了一个新的法律关系，即侵权，由于你的行为侵犯了他人的正常经营权，对方当然有权制止你。
综上，法律已经规定了诉讼保全等措施来保障你的权利，在诉讼期间如果采取堵门等方式侵犯他人的权益，法律是不会保护你的，且还有可能受到其他不必要的损失，所以，维权要依法、合理进行。
