首先，事业单位、企业和公司主要区别如下：
一、主体资格和设立资金的来源不同
事业单位在法律上讲属于事业法人，企业（包括公司）属于企业法人。由于这一性质，决定了设立事业单位的资金主要是国家拨款，或由国有企业、事业单位筹措。设立企业（包括公司）资金是由出资者投入的。
二、设立主体和设立目的不同
事业单位大都是由国家（包括国家机关和地方政府）设立的，也有一部分是由国有企业设立的，如大型国有企业原有的医院、学校。国家设立事业单位是出于国家管理的需要或社会公共利益的需要，事业单位的工作和服务不以盈利为目的。例如，学校、公立非盈利医院（当然，现实并非完全如此）。
设立企业（包括公司）的是出资者，国家设立企业时，其也应是出资者。设立企业的目的是通过经营盈利，国有企业也是如此。
三、管理主体和管理方式不同
对事业单位的管理，主要是由政府主管部门负责的。事业单位往往有其隶属的政府主管部门。政府主管部门主要是依靠行政管理的法规、规章、条例、命令和政策对事业单位进行领导和管理。例如国家对公办学校的管理。国家对企业的管理只是宏观管理，企业的管理主要由出资者依法建立的包括董事会和总经理在内的管理团队来负责。根据企业的性质不同，出资者对于企业的管理分别依据公司法、企业法、中外合资企业法等法律来进行管理。对于公司的管理，出资者还应当遵守公司章程的规定。
四、企业（包括公司）在其经营过程中，需要向国家缴税，而事业单位则不需要缴税。
其次，企业和公司也是有区别的：
公司属于企业，但企业并不一定就是公司。因为企业有各种类型，如工厂、合伙企业、商店等，公司只是企业类型中的一种。
