预付款的目的是解决合同一方周转资金短缺，其作用在于帮助对方解决资金上的困难，使之更有条件适当履行合同，具有支援的性质。
按照约定的时间和比例逐次扣回，即是合同的一种关于费用支付与返还的约定形式，也是为了使工程款项的使用更符合工程进展需要和满足工程需求。
工程预付款是建设工程施工合同订立后由发包人按照合同的约定，在正式开工前预先支付给承包人的工程款。它是施工准备和所需主要材料、结构件等流动资金的主要来源，国内习惯上又称为预付备料款。工程预付款的支付，表明该工程已经实质性启动。
《建设工程施工发包与承包计价管理办法》第14条明确规定：预付工程款的具体事宜由发承包双方根据建设行政主管部门的规定，结合工程款、建设工期和包工包料情况在合同中约定。
《建设工程施工合同（示范文本）》中，有关工程预付款作了如下约定：“实行工程预付款的，双方应当在专用条款内约定发包人向承包人预付工程款的时间和数额，开工后按约定的时间和比例逐次扣回。预付时间应不迟于约定的开工日期前7D。发包人不按约定预付，承包人在约定预付时间7D后向发包人发出要求预付的通知，发包人收到通知后仍不能按要求预付，承包人可在发出通知后7D停止施工，发包人应从约定应付之日起向承包人支付应付款的贷款利息，并承担违约责任。”
