首先提醒，“ubuntu桌面Windows安装版”这种说法不妥当。你说的那个应该是指wubi，是开发团队为了迎合Windows用户做的东西，就是让用户更加方便地把ubuntu安装在Windows下，在Windows的分区下创建一个虚拟硬盘文件存放ubuntu的内容，并不能算真正的安装操作系统（而且用wubi安装的话虽然卸载很容易，但是容易出问题，强烈不建议）。如果真的要【安装】的话，建议刻盘，然后从光盘引导进行安装。
至于桌面环境。
1、Ubuntu，使用的是Gnome，这个桌面环境的特点是稳定性好，美观度一般，定制性超强，但是可以配置得很漂亮，搭配compiz之类的软件，想怎么搞就怎么搞，这个是后话，有兴趣去ubuntu中文论坛上看看。http://forum.ubuntu.org.cn/。贴一张我的（在网上找的Macbuntu主题，模仿的mac可以乱真）
2、Ubuntu Netbook，也是用的Gnome，但是采用了不同的的桌面样式›，用起来也和desktop版本的不太一样，图片可以百度，这个适合装在小屏幕的上网本上。
3、Kubuntu，使用的是kde，也就是K-桌面环境（K-Desktop Environment），使用Qt库，动态效果很棒，UI非常华丽（秒杀Win7），而且操作起来很友好（相对于Gnome），有很多实用的Widget，类似于Windows的小工具，缺点是稳定性不好，配置自由度不如Gnome。
4、Kubuntu Netbook，不清楚
5、Xubuntu，用的是Xfce，这个桌面环境最大的特点是节省资源，也就意味着美观度较差，但是库和Gnome一样都是Gtk的库，所以图标和Gnome差不多。这个桌面环境非常适合配置不高的机器使用，节约资源
ps：如果你的硬盘空间够大，可以安装多个桌面环境，想换哪个就换哪个
具体命令（假设你原来用的是Ubuntu gnome）
sudo apt-get install kubuntu-desktop
sudo apt-get install xubuntu-desktop
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