新农合出院报销是有时间限制的，要求在出院10日内办理报销手续。一般情况下，应该是医院结算串钩直接结算的。具体如下：
1、参合农民在县内定点医疗机构就诊，不需办理转诊手续；
2、转诊到县外定点医疗机构就诊者，须持县级定点医疗机构的诊断和转诊证明报县合管办审批；
3、经批准登记并在出院10日内持有关证件到县合管办按照市级或市级以外就诊执行补助，否则不予补助。
4、为照顾到部分参合农民在县外就诊后因跨年度的原因不能及时按照要求返回县内进行补偿，该县每年都会将跨年度补偿的时间延后至本年度的2月底。
下列医疗费用不纳入新农合基金支付范围：
1、应当由公共卫生负担的；
2、应当从工伤保险基金中支付的；
3、应当由第三人负担的；
4、因故意犯罪、酗酒、吸毒、自杀、自残、斗殴等造成的；
5、在境外就医的；
6、超出新农合报销基本药物目录、基本诊疗项目和医疗服务设施目录范围的。
