出国常青藤。如果是国内的话，
1.中科院计算所（中国科学院大学）
2.清华大学
3.国防科技大学
不分先后。中科院的侧重科研，拥有国内最先进的科研装置，出国的机会多，拥有联想，龙芯等一系列控股公司。交大的本科，硕博毕业也不用担心就业问题。
清华最突出的优势就是国内最强大的校友资源，不过我不大喜欢那里氛围。去过一次夏令营，感觉氛围有点浮躁。下属公司：清华同方。
国防科大的话，就是机密性大。承接了中科院计算所研制超级计算机的任务，超级计算机研究处于世界领先地位，代表产品有银河，天河系列超级计算机。同时，国防科大的编程方面同样处于领先水平，盛产红客。较之前俩者劣势就是就业问题。如果报考军硕，就得参军服务，这是一条不好说的路。如果报考地方硕士，13年招的首届地方硕士，目前3届，所以就业劣势大，无校友资源。
其他院校的话，北航还行，但是不建议去，可能留在交大是个更好的选择。
个人建议，仅供参考。
