蜜柚对施肥管理，对营养的需求是相当高的，比一般的柑橘品种，比如砂糖橘、脐橙、贡柑等都要较难管理，稍有不慎就会出现黄树、败树、黄叶、大小年等问题。原来柚子由于叶片和果型都比较大，所以在营养的需求上，除了需满足氮磷钾的需求外，其对钙镁锌硼的需要量比普通柑橘品种要高30-50%。而在实际的管理中，柚农们对氮磷钾的补充很重视，普遍一年要追施4-5次复合肥，每次施用量也很高，而钙镁锌硼的补充却严重不够。当蜜柚缺钙后，会影响根系的生长，毛细根很少，吸肥能力有限，尽管施了大量的复合肥，树势还是不好，甚至出现败树黄树现象。蜜柚缺镁，直接导致的就是黄叶，特别是进入膨果期、采果后黄叶问题更加突出，甚至发展到很多蜜柚园子因为缺镁太严重春梢出来就无法正常转绿。而缺锌缺硼，则会影响柚子树正常的花芽分化，造成大小年现象，败树、黄叶和超负荷挂果更是加剧了大小年的发生。
蜜柚每年的几次关键施肥，冬肥、春肥、定果肥、膨果肥、采后肥，除了要通过施用有机肥增加土壤有机质含量，施用复合肥补充大量元素氮磷钾外，还要补充钙镁锌硼等微肥营养，在撒施、埋施复合肥或有机肥的时候，加入微补倍力颗粒剂（钙15%镁5%锌1%硼1%）3两/树，可有效平衡营养，预防蜜柚的各种缺素症状，减少败树、黄叶和大小年的发生。同时，在蜜柚营养需求高的关键时期，比如壮花期、保果期、膨果期，还要通过叶面喷施补给各种速效养分。
