第二季结束后就是UW篇了，uw篇开始是介绍桐人应菊冈诚二郎的邀请去进行打工（就是潜行到UW里，在那里桐人，优吉欧，爱丽丝都还是小孩，后来爱丽丝被抓走），在结束打工的某一天跟亚丝娜一起在街上时被原微笑棺木的成员注射了药物，导致大脑受损，被送去拉斯总部进行治疗。
当桐人在UW里醒来时，遇见了优吉欧，经过一段时间后他们启程去找爱丽丝。后来在帝立修剑学院进行学习。但由于为了拯救自己的学妹不被上级贵族强暴而和桐人损害了对方的天命（web版是优吉欧杀的，但文库版是桐人杀的），两人一起成为罪人。于是不得不离开学院。后面就是桐人跟优吉欧一起到达中央大教堂，在那里进行战斗（主要是为了干掉最高祭祀）。在那里也遇见了爱丽丝。由于桐人与爱丽丝战斗时不小心从80层掉下去了（好像是），就跟爱丽丝达成停战协议，回到上面去。在这过程中，爱丽丝逐渐转变了自己之前的那种想法，选择了跟桐人并肩作战。然而当他们回去时优吉欧已经被最高祭祀洗脑了，于是与桐人进行战斗。不过，最终在与最高祭祀的战斗中，优吉欧最终清醒，但最终战死。同时还有Cardinal（潜伏于隐藏图书馆的另一名最高祭司）也一起死去。不过桐人还是击杀了最高祭祀，但由于好友的死去，他失去了灵魂，同时右手也断了，但由于他本人精神上的打击太大，没有变回原样。战斗结束后被爱丽丝带回露莉德村，与他同居半年并形影不离地照顾其生活起居。
后面就是现实中拉斯被袭击，为了更好的保护爱丽丝，同时也是为了桐人，亚丝娜使用GM帐号“创世之神·丝提西亚”登入Under World，与桐人并肩作战。当然，诗乃，莉法等也登入了UW里。在UW里他们同加百列以及其它国家的玩家开始了战争。（加百列是为了夺取爱丽丝）。其中也有亚洲的国家的玩家（比如中国和韩国）。日本本土的ALO里的玩家也进入UW进行战斗。桐人也用外挂一般的技能秒了3万人。最后桐人他们获胜。爱丽丝也在战争后期在桐人他们的帮助下离开UW，也成为出现在现实世界里的第一个AI。但因极限加速被开启的缘故而与桐人一同留在Under World内近二百年的时间。在此期间与桐人结婚，并被推举为Under World的星王后，与桐人一起治理Under World。在经过了现实世界的两个月后，于爱丽丝的呼唤下奇迹般与桐人一同醒来，然后与桐人将这两百年间的记忆全数删除。在web版小说最后就是爱丽丝感到了UW的呼唤，并叫上桐人一起去UW里，桐人给家人留言说去完成最后的任务。爱丽丝回去消灭了神话级宇宙兽，最后是开放式结尾(不过综合来看的话，桐人爱的是亚丝娜，恋人方面来看的话，个人观点，而且，桐人跟其她的女主只是有点暧昧，放放闪光弹什么的)
web篇最后的内容
出生于Under World的少女，整合机士斯提嘉·施特莉涅恩，操纵机龙慢慢飞翔着。
向着在远方挥手的，陌生而又令人怀念的剑士们。
向着下一个时代的大门。
向着未来。
故事至此完结
但是，桐人与亚丝娜
莉珐和诗浓等人
以及爱丽丝的战斗
此后还会继续
他们与他们的后代
再次将剑握在手中
是在被称为
最终的最大战场
『智能间的战争』上
发生的事情了
所有的可能性
如今还只是位于
不确定的光之彼岸
微微摇动
只是微微摇动
THE END
2005.01.31 - 2008.07.25（也许文库版的结局会有改变吧）
我重点是看的文库版，目前文库版到15卷，web部分内容在文库版有改变。
