分别有齐康（一期工程）、何镜堂（二期工程）、何镜堂和倪阳（三期工程）设计。
1、一期工程，纪念馆一期占地面积3万平方米，建筑面积5千平方米。由东南大学建筑学院齐康设计，以“生与死”、“痛与恨”为主题。
2、二期工程，纪念馆展馆的整体设计形状为“和平之舟”，展馆的建筑设计由华南理工大学何镜堂院士主持。
3、三期工程，由中国工程院院士何镜堂及中国建筑设计大师倪阳共同领衔的华南理工大学建筑设计研究院团队设计，三期工程的设计风格上与已建成的纪念馆部分协调、呼应，又凸显自己的特色。
扩展资料
侵华日军南京大屠杀纪念馆分展览集会区、遗址悼念区、和平公园区和馆藏交流区等4个功能性区域。
（一）展览集会区：该区分为史料陈列厅和集会广场。史料陈列陈列展示基本陈列和专题陈列。
（二）遗址悼念区：该区包括“古城的灾难”大型组合雕塑、“历史证人的脚印”铜版路、《狂雪》诗碑墙等。
（三）和平公园区：该区以和平为主题，是世界各国人民进行和平交流的重要场所。包含胜利之墙、和平公园、汉白玉雕塑《和平》等。
（四）馆藏交流区：该区是寓馆藏、交流、办公为一体的综合功能区域，其主要设施有学术报告厅、图书馆、特藏库等。
参考资料来源：百度百科-侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆
