首先，它们的给付性质是不同的，意外伤害保险大都是定额给付，具有给付性，即经济帮助的性质，而健康保险的给付保险金大都具有补偿性，其给付的形式包含定额给付、预付服务及实际补偿这三种形式在内。
其次，短期健康保险和意外伤害保险的保险责任不同。意外伤害保险主要强调事故的外来性，而健康保险则主要把因身体内部疾病引起的治疗作为保险事故；两者的区别，在意外伤害上表现得很明显，因意外伤害而住院治疗的，健康保险将给付医疗保险金，而意外伤害保险则待医疗终结，确定为残疾时，才给付伤残保险金；因为疾病而造成的伤残和死亡，是健康保险的保险责任，而意外伤害保险的保险责任是意外伤害造成的伤残和死亡。
