企业店铺和旗舰店有以下几种区别：
一、性质的区别
企业店铺是指通过支付宝商家认证，并以工商营业执照开设的店铺，是以公司名义建立的淘宝店，也就是常说的“淘宝集市店”。旗舰店是国家商标总局颁发的商标注册证或商标受理通知书（转让中的商标不可以）的自有品牌入驻商城，所开设的店铺称为“品牌旗舰店”。
二、首页上标识的区别
企业店铺天猫和淘宝都可以开，在前台展示上，有定制的店铺套头，会展示企业店铺的标识。旗舰店只在天猫有，标识直接为xxx旗舰店，淘宝是不允许开旗舰店的。
三、产品的区别
旗舰店的经营范围必须是同一品牌、不同类目下的所有产品，而企业店铺可以经营不同品牌的多种类目产品。
扩展资料：
淘宝和天猫大的店铺分类：
天猫系：旗舰店、专营店。
淘宝系：淘宝个人C店、企业店铺。
总的来说，旗舰店肯定要比企业店铺更放心。因为能开旗舰店的都是相关品牌的总代或者品牌所属方，至少可以保证买的是正品。
而企业店铺，只要有工商局注册，都可以开，其实大多数是个人开的小公司。或者个体经营者。资质要求并不高。并不能保证你一定可以买到正品。
当然，除了淘宝企业店铺和旗舰店区别，还可以看看旗舰店与专卖店及淘宝C店之间的区别，更加详细了解不同店铺的状况：
旗舰店是要自己的品牌，一般都是厂家;专卖店是只能卖一个品牌，可以是代理，专营店就像卖场一样，什么牌子都行。
旗舰店：品牌的持有者/持有公司自己开的商城店。
专卖店：品牌的一级授权商/代理商/分销商，只能经营一个品牌。
专营店：同时可以经营多个品牌，所经营品牌可以自有，也可以由品牌商授权或品牌授权商授权。
旗舰店、专卖店、专营店比较：旗舰店是官方开的，最有保障。专卖店跟实体的专卖店差不多，最放心。专营店是专门经营某一种类的，比如服饰专营店，那么他可以经营多个品牌的服饰，但种类只能是服饰，这种店容易卖假货。
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