福建医科大学的附属医院包括：
直属附属医院：
1、福建医科大学附属协和医院，院址：福建省福州市鼓楼区新权路29号
2、福建医科大学附属第一医院，院址：福建省福州市茶中路20号
3、福建医科大学附属第二医院，院址：福建省泉州市中山北路34号（鲤城院区）；泉州市丰泽区东海大街950号（东海院区）
4、福建医科大学附属口腔医院，院址：福建省福州市鼓楼区杨桥中路246号
非直属附属医院（含临床医学院）：
5、省立临床医学院（省立医院），院址：福建省福州市东街134号
6、福总临床医学院（福州总医院），院址：福建省福州市西二环北路156号
7、福建医科大学附属漳州市医院，院址：漳州市胜利路59号（市政府对面）
8、福建医科大学附属泉州市第一医院，院址：福建省泉州市东街248-252号
9、福建医科大学附属三明第一医院，院址：福建省三明市列东街29号
10、福建医科大学附属龙岩第一医院，院址：福建省龙岩市九一北路105号
