化肥见效快单一方便，缺点是过量使用或长时间使用造成的土壤结构改变，环境污染等严重后果，影响人体健康。
生物有机肥是指特定功能微生物与主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
生物有机肥的特点
1、养分齐全，同时能有效提高肥料养分的利用率，后劲足。生物有机复合肥内含有大量的有机质，同时含有益微生物菌群，菌群的环境适应性强，易发挥出种群优势，营养功能强，根际促生效果好。它综合了有机肥“稳”、菌肥“促”的优势，形成了一种营养合力，不仅可以满足农作物的营养需求，而且可使肥料的养分利用率由30％左右提高到40％～50％，减少了肥料施用中的不必要浪费和肥料损失。
2、具有使农作物增产和提高农产品品质的双重功效。试验证明，与化肥等价施用生物有机复合肥，一般可使蔬菜、药材、茶叶、果树等高效经济作物增产20％～30％，块茎类作物增产50%～100%；在减少化肥用量75％条件下仍能达到甚至增加蔬菜类农作物的产量。
3、生物有机肥的增质主要表现在维生素C和β-胡萝卜素的增加、硝酸盐含量的降低及单裸（条）的增加，即外观和内质的改进。促使作物根系发达，苗壮杆粗，抗倒伏。与施用化肥比较，蔬菜、水果上市提前，属于天然、绿色、无公害农产品。
4、对经济收益的影响。由于生物有机肥明显的增加了作物产量，改进了品质，特别是口味和外观较好，因而能取得较显著的经济收益，蔬菜、果树一般亩年增收均千元以上。
5、解决作物重茬种植问题。抑制病原微生物的致病作用，增强植物的抗逆能力，减少农药的使用，促进良性循环。
6、改土培肥。长期施用能逐年增长土壤有机质含量和有益菌群比例，如固氮菌、解磷、解钾菌，能提高土壤有效氮、磷、钾的供应；改善土壤的理化、生物性状，提高作物的养分吸收能力。
