根据你的描述，貌似目前是机械硬盘（移动硬盘）和电脑上的固态硬盘都有操作系统是吧？既然都曾经独立启动过，那么就是说明磁盘中都有MBR（EFI）引导记录的。
那么我建议，
1.进入电脑的BIOS设置界面去选择一个设备作为启动引导设备（就是选择开启电脑的时候，选择移动硬盘还是固态硬盘为系统引导设备），这样就可以使用某一个系统的引导来启动操作系统
2.然后，假如是启动引导Windows的，就使用EasyBCD这类软件，添加一个启动Ubuntu的选项
3.假如是引导启动Ubuntu的，就修改Grub的配置文件，添加一个Windows的启动选项
具体怎么修改要看你的系统所在硬盘等等不同环境来配置
如果确定了引导设备以后，怎么配置另一个系统的引导，可以按我说的百度一下，比较简单了
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