中国工程物理研究院旗下共有5种主办期刊,如下:
1《高压物理学报》创刊于1987年9月,是我国高压物理领域唯一的专业性刊物
2《含能材料》是中国工程物理研究院主办的学术性期刊,于1993年创刊。
3《爆炸与冲击》：报道爆炸力学学科领域的国内外最新科技成果，反映学术前沿进展及水平，促进学术交流，创造本学科领域青年人才良好的成长环境，推进爆炸理论和应用、抗爆与爆炸安全技术的发展。
4《强激光与粒子束》（High Power Laser and Particle Beams）是由中国工程物理研究院和四川核学会1989年2月创办的国内外公开出版的科技期刊，2003年改为月刊，2008年增加了中国核学会为主办单位。
5《太赫兹科学与电子信息学报》为电子信息类综合性期刊，其前身为《信息与电子工程》，是由中国工程物理研究院主管，中国工程物理研究院电子工程研究所主办、四川省电子学会协办的国内外公开发行的学术期刊，2003年创刊
