一、财政部 国家税务总局《关于医疗卫生机构有关税收政策的通知》（财税〔2000〕42号）规定：
（一）对非营利性医疗机构按照国家规定的价格取得的医疗服务收入，免征各项税收。不按照国家规定价格取得的医疗服务收入不得享受这项政策。
（二）医疗机构需要书面向卫生行政主管部门申明其性质，按《医疗机构管理条例》进行设置审批和登记注册，并由接受其登记注册的卫生行政部门核定，在执业登记中注明“非营利性医疗机构”和“营利性医疗机构”。
二、关于营利性医疗机构的税收政策
（一）对营利性医疗机构取得的收入，按规定征收各项税收。但为了支持营利性医疗机构的发展，对营利性医疗机构取得的收入，直接用于改善医疗卫生条件的，自其取得执业登记之日起，3年内给予下列优惠：对其取得的医疗服务收入免征营业税；对其自产自用的制剂免征增值税；对营利性医疗机构自用的房产、土地、车船免征房产税、城镇土地使用税和车船使用税。3年免税期满后恢复征税。
（二）对营利性医疗机构的药房分离为独立的药品零售企业，应按规定征收各项税收。
为了强化税收征管，堵塞税收漏洞，目前，区地税局所属各分局正在进行税源普查。根据《中华人民共和国征收管理法》第十五条规定，社区卫生服务站也应该办理税务登记手续，社区卫生服务站人员也应赋有缴纳工资薪金个人所得税的义务。
