艾灸任督二肪的作用主要有以下这些：
艾灸任脉：
首先任脉最早记载于《黄帝内经》，为人体经脉之一，属于奇经八脉，有"阴脉之海"之称。
任脉起于小腹，止于眼眶，共有关元、气海等24腧穴。
任脉不通可表现为月经不调，经闭不孕，带下色白，小腹积块，胀满疼痛，游走不定，睾丸胀痛，疝气。任脉虚衰可表现为胎动不安，小腹坠胀，阴道下血，甚或滑胎，月经愆期或经闭，或月经淋漓不尽，头晕目花，腰膝酸软，舌淡，脉细无力。
艾灸任脉主治：
腹、胸、颈、头面的局部病证及相应的内脏器官疾病，少数腧穴有强壮作用或可治疗神志病。如疝气、带下、腹中结块等证。
此经主要有调节阴经气血、调节月经的作用，主要治疗经脉循行部位的相关病症。
艾灸督脉：
督脉循身之背，入络于脑，如果督脉脉气失调，就会出现“实则脊强，虚则头重”的病证，这都是督脉经络之气受阻，清阳之气不能上升之故。由于督总统一身之阳气，络一身之阴气，不仅发生腰脊强痛，而且也能“大人癫疾、小儿惊痫”。同时，督脉的别络由小腹上行，如脉气失调，亦发生从少腹气上冲心的冲疝，以及癃闭、痔疾、遗尿、妇女子不育等证。
督脉起于小腹内胞宫，下出会阴部。
向后行于腰背正中至尾骶部的长强穴，
沿脊柱上行，经项后部至风府穴，进入脑内，沿头部正中线，上行至巅顶百会穴，经前额下行鼻柱至鼻尖的素髎穴，过人中，至上齿正中的龈交穴。
督脉起于长强穴、止于龈交穴，单28穴。
分别是长强、腰俞、腰阳关、命门、悬枢、脊中、中枢、筋缩、至阳、灵台、神道、身柱、陶道、大椎、哑门、风府、脑户、强间、后顶、百会、前顶、囟会、上星、神庭、素髎、水沟、兑端、龈交。
调理病症：
主要调理神志病，热病，腰骶、背、头项局部病证及相应的内脏疾病。如颈项强痛、角弓反张等证。督脉督一身之阳气，只要是阳气衰弱都可以在督脉上找到合适的穴位进行治疗。
