增值税发票税率17%和税率3%的不同主要是纳税人属性不同，税率17%适用于一般纳税人，税率3%适用于小规模纳税人。
关于一般纳税人和小规模纳税人：
一般纳税人指的是年应征增值税销售额超过财政部规定的小规模纳税人标准的企业和企业性单位，增值税进项税额可以抵扣销项税额；
小规模纳税人指的是年销售额在规定标准以下，并且会计核算不健全，不能按规定报送有关税务资料的增值税纳税人，会计核算不健全是指不能正确核算增值税的销项税额、进项税额和应纳税额。
关于这两种税率发票的不同在于增值税发票种类的不同：
税率17%的增值税发票：
增值税普通发票；
增值税专用发票；
出口商品专用发票。
税率3%的增值税发票：
通用机打发票；
通用手写发票；
国税局代开的增值税专用发票。
关于这两种发票的具体区别如图所示：
