营改增政策中，物流企业属于“物流辅助服务”范围，年收入额（不含税）在500万元以上为增值税一般纳税人，适用6%的增值税税率，低于500万元，则为小规模纳税人。
物流公司是一般纳税人，如果对商业企业（一般纳税人）抵扣可抵6%
一般纳税人能同时开具增值税专用和普通两种发票。因为是增值税一般纳税人，无论是开增值税专用发票，还是增值税普通发票，其税率都一样为6%，如果有适用不同税率的经营项目，则税率不同。
比如，某物流公司从事物流服务，并提供货物运输，那么，货物运输、物流服务分别适用不同的税率：货物运输11%，物流辅助6%，开票必须按照不同的经营范围分别开票，同时必须对不同税率的项目分开核算，否则，税务部门会按照就高不就低的原则，将税率低的服务项目也按照高税率征税。
扩展资料：
增值税税率是指增值税应税产品的总体税额与销售收入额的比例。由于增值税以应税产品的增值额为课税对象，同时又必须保持同一产品税负的一致性，因此，从应税产品的总体税负出发来确定适用税率是增值税税率设计的一大特点。
增值税税率一般与增值税扣除税率同时使用才能按增值税“扣税法”计税。现行增值税实行产品比例税率，分为8%，12%、14%、16%、18%、20%、21%、23%、26%、30%、43%、45%12个档次。多数产品的税率是在原工商税、产品税税负基础上换算确定的，部分产品的税率，在原税负的基础上作了适当调整。
（1）纳税人销售或者进口货物，除以下第二项、第三项规定外，税率为16%。
（2）纳税人销售或者进口下列货物，税率为11%：粮食、食用植物油、自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品、图书、报纸、杂志、饲料、化肥、农药、农机、农膜、农业产品、以及国务院规定的其他货物。
（3）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。
（4）纳税人提供加工、修理、修配劳务税率为16%。纳税人兼营不同税率的货物或者应税劳务。
年销售额达不到前述标准的为小规模纳税人，此外个人、非企业性单位以及不经常发生增值税应税行为的企业也被认定为小规模纳税人。小规模纳税人在达到标准后经申请被批准后可以成为一般纳税人。
对小规模纳税人实现简易办法征收增值税，其进项税不允许抵扣。
小规模纳税人销售货物或应税劳务的增值税税率为3%。
①对应税服务适用零税率，意味着应税服务能够以不含税的价格进入国际市场，从而提高了本市出口服务企业的国际竞争力，为现代服务业的深入发展和走向世界创造了条件。对于调整完善我国出口贸易结构，特别是促进服务贸易出口具有重要意义。
②对于适用零税率的应税服务的具体范围，包括试点地区的单位和个人提供的国际运输服务、向境外单位提供的研发服务和设计服务适用增值税零税率。
其中：国际运输服务是指：
a、在境内载运旅客或者货物出境；
b、在境外载运旅客或者货物入境；
c、在境外载运旅客或者货物。
同时，向境外单位提供的设计服务，不包括对境内不动产提供的设计服务。
参考资料：百度百科-增值税税率
