君子兰的根为簇状粗壮的肉质根，含水量多，质脆嫩，易折伤，稍有管理不善，容易产生烂根。一般表现为幼苗期从叶基以下腐烂。成龄植株多从根的中部以下腐烂。产生烂根后，新叶生长缓慢或停止生长，叶片发黄瘦弱，老叶逐渐焦枯死亡，烂根严重时，全株枯死。
君子兰烂根的主要原因有以下四点：
1.施肥不当。施用未腐熟的有机肥，或施肥浓度过大，一次施肥过多，引起反渗透枯根或烧伤烂根。
2.土壤渍水。君子兰根粗含水多，好气性强，浇水过多，土壤渍水引起缺氧烂根。特别是夏秋高温期浇水过量，造成水煮烂根。
3.土壤板结、碱化。培养土基质搭配不合理，缺乏有机质，土壤板结透气不良；或配有未腐熟的有机肥烧伤；土壤碱性过重等也会引起根系腐烂。
4.病菌感染。根系受到损伤，病菌从伤口入侵，感染根腐病、疮痂病为害，引起烂根。
君子兰烂根防治措施有：
1.配制好培养土。君子兰培养土总的要求要达到肥沃、疏松、透气、有机质多、微酸性（pH5.5—6.5）、无病虫。培养土可用塘泥、腐叶土、菜园土、堆肥土、草木灰、河砂等不同基质，按一定比例组合配制。配制好的培养土，经过炒、晒、蒸煮法，或用福尔马林、二硫化碳、高锰酸钾等药剂消毒灭菌后使用。每次换盆时，要用经过消毒灭菌的新培养土。
2.防止根系创伤。君子兰幼苗移栽上盆或老株换盆，尽量带土移栽，防止根系损伤，以免伤口被病菌感染。
3.合理浇水、施肥。君子兰的肥水管理，必须十分谨慎，浇水、施肥不当，是造成烂根的重要原因之一。做到适时适量浇水，以保持盆土湿润为原则，严防盆内渍水。施肥做到：有机肥必须充分发酵腐熟，薄肥勤施，不施浓肥，结合抗旱水施，不干施肥，以防水害、肥害烂根。
4.防治病害。引起君子兰烂根主要有根腐病与疮痂病，在加强肥、水管理与培养土严格消毒及根系保护，增强抗病力的基础上，掌握在发病初期用托布津、多菌灵、退菌特、石硫合剂等农药稀释液浇根或喷洒，控制为害烂根。
5.烂根后的挽救。发现烂根的君子兰病株，连土从盆内脱出，轻轻磕去泥土用清水冲洗干净，剪除腐烂根块，用0.1%高锰酸钾浸泡5分钟消毒，然后在伤口上蘸硫磺粉或草木灰，或200倍液硫酸铜，放阴凉通风处晾干伤口2天至3天，再换新土上盆栽植。烂根严重的植株，经修根消毒处理后，先在砂中培养，待发出新根后，重新上盆栽植。
